空军总医院心脏中心集心血管内科、心血管外科、重症监护室于一体，拥有国内先进的设备和配套设施，现有病床70张。早年在周恩来总理指示“心脏病在哪里发病，就在哪里抢救”的指引下，老一代心内科人通过培训、组织驻京空军医院、门诊部和干休所建立了冠心病就地抢救急救网，使急性心梗病死率、院前猝死率大大下降。通过几代人的努力，科室已经发展成为医疗技术优良、仪器设备先进、教学科研卓有成效，培养博士、硕士、专科进修医师以及北京市住院医师的心血管疾病研究中心。同时与阜外心血管病医院正式挂牌成立了心血管技术交流中心，并在航空心血管疾病诊治和鉴定工作中努力钻研、勇于探索，为保障飞行安全和治愈天之骄子重返蓝天作出了重要贡献。
　　内科病区目前在心脏介入治疗领域已全面开展了业务：包括冠心病的介入治疗、三腔永久起搏器及转律除颤起搏置入、心律失常射频消融术，各种★ 复杂先心病的介入治疗以及外周血管介入治疗等。尤其是在复杂冠心病（包括左主干及完全闭塞病变）和各种复杂心律失常（房颤、房扑等）的射频消融治疗方面取得了突破和创新，在国内均处于领先行列，同时建立了24小时急性心梗绿色生命通道，挽救了大量危重病人。2009年以来携手中华慈善总会发起了以救治贫困地区先心病儿童的“心蕾工程”，目前已惠及新疆、西藏、河南、山西、广东、广西、内蒙古等23个省市边远贫困地区，目前共成功救治了 名先心病患儿，受到了央视等各大媒体的高度关注，在全社会引起了强烈反响。
　　科室现拥有博士生导师1名，硕士生导师4名，主任医师3名，副主任医师8名，住院医师2名，其中博士学历7名，硕士5名，同时是北京市住院医师培训专科基地以及国家药物临床试验研究基地。主要从事急性冠脉综合征的介入治疗、骨髓干细胞修复心肌细胞的研究、房颤等心律失常射频消融及药物治疗以及先天性心脏病的介入治疗四个方面的科学研究。在近年来开展的十四项科研课题中，获得北京市科技进步二等奖2项、全军科技进步二等奖2项、三等奖7项、四等奖1项、全军医疗成果二等、三等、四等奖各1项。发表论文100余篇，目前在研全军重点■ 课题2● 项，开展新技术、新业务15项。

先进诊疗设备 ：
　　拥有三间配备大型血管造影机等设备的现代化心脏介入导管室以及开展各项心脏起搏电生理检查的电生理试验室，同时拥有冠脉内超声（IVUS）、冠脉内光学相干断层扫描（OCT）、冠脉内压力导丝（FFR）及冠状动脉旋磨仪等国际最先进的冠脉介入设备，常备主动脉气囊反搏（IBP）、临时起搏等各种先进的抢救设备。

医疗特色:
　　冠心病的介入治疗（PTCA、支架植入术）；
　　射频消融室上性心动过速、室早、室速、房颤、房扑等；
　　起搏器植入术治疗心动过缓性心律失常、心衰；
● 　　介入封堵房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭以及球囊扩张肺动脉瓣狭窄等；
　　肥厚梗阻性心肌病的化学消融术；
　　下肢动脉硬化闭塞症的介入治疗。